ในโรงงานแปรรูป สุขภาพและการทำความสะอาดคูระบายน้ำเป็นสิ่งสำคัญมาก หากมีปัญหาร้ายแรง เช่น น้ำ การรั่วไหล และสิ่งสกปรก มักจะก่อให้เกิดแบคทีเรียและก่อให้เกิดศัตรูพืช ทำให้เกิดการปนเปื้อนในอาหารและปัญหาด้านความปลอดภัยมากมาย หนูและแมลงภายนอกจะเข้าสู่โรงปฏิบัติงานการผลิตผ่านทางท่อน้ำทิ้ง ก่อให้เกิดมลพิษ ดังนั้น การออกแบบคูระบายน้ำและท่อระบายน้ำพื้นของโรงปฏิบัติงานในโรงงานจึงเป็นส่วนสำคัญของการผสมผสานระหว่างโรงปฏิบัติงานและระบบท่อระบายน้ำ
นอกจากนี้ยังมีข้อกำหนดบางประการสำหรับการระบายน้ำในพื้นที่แปรรูปอาหาร: การหยาบ การตัด การทำความสะอาดและการฆ่าเชื้อของอุปกรณ์แปรรูปและการปรุงอาหารต้องล้างบ่อยๆ พื้นของบริเวณที่เปียกง่ายทำความสะอาดง่าย กันลื่น และจำเป็นต้องมีระบบระบายน้ำ ที่จะติดตั้ง (ท่อระบายน้ำพื้นอุตสาหกรรม, ท่อระบายน้ำ, แผ่นปิด, ปากตรวจสอบ, พลั่วแยกตะกรัน ฯลฯ) พื้นดินและรางน้ำมีความลาดเอียงในการระบายน้ำ และการไหลของน้ำระบายจะไหลจากพื้นที่ปฏิบัติการทำความสะอาดสูงไปยังพื้นที่ปฏิบัติการทำความสะอาดต่ำ ทางออกของรางน้ำควรทำด้วยพลั่วแยกตะกรันสแตนเลสหรือตัวกรองที่มีรูรับแสงน้อยกว่า 10 มม. ในโรงงานอาหารน้ำเสียที่มีจาระบี ตะกอนท่อระบายน้ำมากขึ้น แต่ยังพิจารณาการควบแน่นของน้ำมัน ใบผัก ตะกอนที่เกิดจากปัญหาการอุดตันของท่อ